Vědecká práce Střediska vychází z pedagogických potřeb pracoviště, jeho dlouhodobého tematického zaměření a ze znalosti trendů, které se prosazují v ibero-amerických studiích v mezinárodním měřítku. Středisko seznamuje mezinárodní odbornou veřejnost se svojí činností v odborném časopise Ibero-Americana Pragensia, SIAS také udržuje intenzivní kontakty s řadou evropských i amerických univerzitních pracovišť.

Vedle individuálních grantů a projektů jsou pracovníci Střediska v současné době zapojeni do dvou významných badatelských programů:  PROGRES Q09: Historie – Klíč k pochopení globalizovaného světa; a KREAS (Kreativita a adaptabilita jako předpoklad úspěchu Evropy v propojeném světě, projekt financovaný z Evropského fondu pro regionální rozvoj).